Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ETV1P50549 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ETV1P50549 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ETV1P50549 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ETV1P50549 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ETV1P50549 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms