Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSEN2P49810 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms