Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RARRES1P49788 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES1P49788 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms