Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA1P49639 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms