Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTAP49354 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTAP49354 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTAP49354 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTAP49354 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTAP49354 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms