Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX1P48742 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX1P48742 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX1P48742 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX1P48742 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX1P48742 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX1P48742 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX1P48742 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX1P48742 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX1P48742 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX1P48742 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX1P48742 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHX1P48742 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHX1P48742 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LHX1P48742 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX1P48742 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX1P48742 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms