Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCP4P48539 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCP4P48539 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCP4P48539 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCP4P48539 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCP4P48539 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCP4P48539 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCP4P48539 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCP4P48539 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCP4P48539 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCP4P48539 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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