Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SOX2P48431 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SOX2P48431 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SOX2P48431 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX2P48431 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX2P48431 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX2P48431 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX2P48431 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SOX2P48431 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SOX2P48431 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOX2P48431 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms