Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN1S1P47710 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms