Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL35P42766 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL35P42766 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL35P42766 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms