Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFI27P40305 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFI27P40305 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFI27P40305 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFI27P40305 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFI27P40305 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms