Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP6V1E1P36543 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP6V1E1P36543 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms