Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 FAM111A-211ENST00000533703 4202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-228ENST00000485007 736 ntTSL 510.17□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 PRPF3-202ENST00000467329 2595 ntTSL 510.14□□□□□ -0.794e-14■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF846-204ENST00000587650 561 ntTSL 410.12□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF846-209ENST00000590471 427 ntTSL 39.95□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX56-211ENST00000479602 440 ntTSL 29.91□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 F11-AS1-202ENST00000508110 1512 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 VPS8-203ENST00000422105 811 ntTSL 59.14□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 PRPF3-205ENST00000476970 1005 ntTSL 28.68□□□□□ -1.024e-14■■■■■ 30.9
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GTF2F1P35269 RAB8B-205ENST00000559927 755 ntTSL 58.57□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 TEC-202ENST00000505452 2446 ntTSL 58□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.98□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-252ENST00000620737 702 ntTSL 57.95□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 VPS8-209ENST00000445089 592 ntTSL 57.69□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 EIF5A-203ENST00000355068 923 ntTSL 27.59□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 30.9
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GTF2F1P35269 RBM6-207ENST00000434592 2342 ntTSL 27.18□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 30.9
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GTF2F1P35269 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-214ENST00000464013 397 ntTSL 56.37□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-251ENST00000618708 606 ntTSL 56.18□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 VPS8-208ENST00000441141 549 ntTSL 45.07□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DLEU1-216ENST00000473075 348 ntTSL 54.97□□□□□ -1.614e-13■■■■■ 30.9
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GTF2F1P35269 DLEU1-224ENST00000483444 332 ntTSL 1 (best)4.42□□□□□ -1.74e-13■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 QSER1-203ENST00000527250 448 ntTSL 34.19□□□□□ -1.741e-7■■■■■ 30.9
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GTF2F1P35269 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.062e-8■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 PDCD10-203ENST00000462725 715 ntTSL 520.71■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 30.8
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GTF2F1P35269 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 30.8
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GTF2F1P35269 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.291e-6■■■■■ 30.8
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GTF2F1P35269 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.888e-10■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.358e-10■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -18e-10■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.167e-8■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 RAC2-207ENST00000481215 480 ntTSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.328e-7■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.247e-8■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.437e-8■■■■■ 30.8
GTF2F1P35269 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.249e-10■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.759e-10■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.559e-10■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 211.81□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.471e-8■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 C2orf72-203ENST00000477463 579 ntTSL 412.87□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.634e-7■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.214e-7■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 517.96■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 526.56■■□□□ 1.846e-7■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 LARP1-208ENST00000518892 399 ntTSL 323.37■■□□□ 1.336e-7■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 47.76□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 55.43□□□□□ -1.546e-7■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.395e-13■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 517.57■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 30.7
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 219.58■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 313.45□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.142e-9■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 56.98□□□□□ -1.292e-9■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.442e-9■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 34.38□□□□□ -1.712e-9■■■■■ 30.6
GTF2F1P35269 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 54.37□□□□□ -1.712e-9■■■■■ 30.6
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