Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDXP35241 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDXP35241 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDXP35241 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RDXP35241 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RDXP35241 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RDXP35241 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RDXP35241 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RDXP35241 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDXP35241 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDXP35241 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDXP35241 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDXP35241 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDXP35241 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDXP35241 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDXP35241 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms