Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BMI1P35226 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMI1P35226 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMI1P35226 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMI1P35226 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMI1P35226 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMI1P35226 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMI1P35226 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMI1P35226 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMI1P35226 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BMI1P35226 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BMI1P35226 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BMI1P35226 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BMI1P35226 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BMI1P35226 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BMI1P35226 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BMI1P35226 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BMI1P35226 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BMI1P35226 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BMI1P35226 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms