Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPC1P35052 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPC1P35052 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPC1P35052 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPC1P35052 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPC1P35052 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPC1P35052 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPC1P35052 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPC1P35052 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPC1P35052 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPC1P35052 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPC1P35052 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPC1P35052 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPC1P35052 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPC1P35052 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms