Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCD1P33897 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P33897 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms