Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG3P32926 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG3P32926 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG3P32926 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG3P32926 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG3P32926 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG3P32926 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG3P32926 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG3P32926 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSG3P32926 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSG3P32926 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSG3P32926 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSG3P32926 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSG3P32926 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSG3P32926 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DSG3P32926 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DSG3P32926 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms