Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBP1P32455 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBP1P32455 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBP1P32455 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GBP1P32455 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP1P32455 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP1P32455 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.9 ms