Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPS1P31327 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPS1P31327 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CPS1P31327 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CPS1P31327 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPS1P31327 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPS1P31327 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPS1P31327 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPS1P31327 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPS1P31327 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CPS1P31327 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPS1P31327 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPS1P31327 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPS1P31327 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPS1P31327 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPS1P31327 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPS1P31327 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPS1P31327 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPS1P31327 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPS1P31327 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPS1P31327 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPS1P31327 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPS1P31327 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPS1P31327 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPS1P31327 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPS1P31327 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPS1P31327 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPS1P31327 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPS1P31327 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPS1P31327 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPS1P31327 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CPS1P31327 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPS1P31327 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPS1P31327 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPS1P31327 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPS1P31327 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPS1P31327 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPS1P31327 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPS1P31327 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPS1P31327 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPS1P31327 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms