Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC8P31273 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC8P31273 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms