Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-FP30511 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms