Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD38P28907 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD38P28907 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD38P28907 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD38P28907 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD38P28907 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD38P28907 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD38P28907 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD38P28907 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD38P28907 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD38P28907 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD38P28907 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD38P28907 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD38P28907 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD38P28907 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD38P28907 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD38P28907 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms