Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB4P21439 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB4P21439 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms