Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA5P20719 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms