Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2B1P20020 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B1P20020 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms