Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CXCL3P19876 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms