Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR2CP19387 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms