Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD58P19256 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD58P19256 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD58P19256 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD58P19256 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD58P19256 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD58P19256 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD58P19256 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD58P19256 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD58P19256 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD58P19256 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD58P19256 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD58P19256 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD58P19256 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD58P19256 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms