Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAV1P15498 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAV1P15498 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAV1P15498 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAV1P15498 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAV1P15498 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAV1P15498 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAV1P15498 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAV1P15498 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VAV1P15498 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAV1P15498 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAV1P15498 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAV1P15498 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAV1P15498 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAV1P15498 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAV1P15498 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAV1P15498 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAV1P15498 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAV1P15498 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms