Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCL5P13501 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCL5P13501 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCL5P13501 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCL5P13501 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL5P13501 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL5P13501 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL5P13501 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL5P13501 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL5P13501 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL5P13501 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL5P13501 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL5P13501 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL5P13501 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL5P13501 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL5P13501 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL5P13501 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL5P13501 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms