Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GP1BBP13224 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms