Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODC1P11926 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ODC1P11926 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODC1P11926 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODC1P11926 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODC1P11926 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms