Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP2C9P11712 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP2C9P11712 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP2C9P11712 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP2C9P11712 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP2C9P11712 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP2C9P11712 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP2C9P11712 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP2C9P11712 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP2C9P11712 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms