Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VSIG8P0DPA2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VSIG8P0DPA2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms