Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C8orf88P0DMB2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms