Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD1P0DJD0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD1P0DJD0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms