Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM228BP0C875 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM228BP0C875 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms