Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMBP08949 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMBP08949 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMBP08949 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMBP08949 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMBP08949 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMBP08949 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NMBP08949 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NMBP08949 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NMBP08949 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NMBP08949 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms