Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB1P08238 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB1P08238 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms