Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGB3P05106 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3P05106 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms