Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYMSP04818 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TYMSP04818 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TYMSP04818 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TYMSP04818 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TYMSP04818 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms