Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX58O95786 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX58O95786 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX58O95786 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX58O95786 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX58O95786 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX58O95786 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX58O95786 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX58O95786 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX58O95786 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX58O95786 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX58O95786 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX58O95786 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX58O95786 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX58O95786 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX58O95786 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX58O95786 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms