Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB6O95452 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB6O95452 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB6O95452 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB6O95452 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB6O95452 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB6O95452 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB6O95452 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJB6O95452 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJB6O95452 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB6O95452 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB6O95452 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms