Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF4AO95239 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4AO95239 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms