Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDKL5O76039 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL5O76039 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms