Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCNKO75909 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCNKO75909 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCNKO75909 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNKO75909 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNKO75909 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNKO75909 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNKO75909 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNKO75909 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNKO75909 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNKO75909 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNKO75909 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNKO75909 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNKO75909 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms