Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms