Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
ABCC9O60706 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ABCC9O60706 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC9O60706 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC42■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms