Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL4O60488 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL4O60488 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL4O60488 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL4O60488 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL4O60488 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL4O60488 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL4O60488 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL4O60488 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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ACSL4O60488 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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ACSL4O60488 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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ACSL4O60488 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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ACSL4O60488 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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ACSL4O60488 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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ACSL4O60488 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSL4O60488 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
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